預凍階段是凍干機真空冷凍干燥過程的一個環節，預凍過程是一個液相變為固相的過程。預凍的方法基本有兩種，一種是在凍干機干燥室內直接進行預凍的箱內法，另外一種是箱外法，配套超低溫冰箱或者低溫冷庫進行低溫冷凍。
箱內法就是在凍干箱內預凍，大部分產 品凍干使用這一方法，盛裝產品的容器直接放置在凍干箱的板層上冷凍干燥，直至出箱， 不需轉移，比較方便。
而箱外法一般是大型凍干機生產，提高凍干生產效率，直接在低溫冷庫進行預凍，然后在移入大型凍干機干燥室內進行真空冷凍干燥；也有些在實驗室場所，有些產品無法在實驗室凍干機的凍干箱內預凍，例如大的血漿瓶，瓶子高，裝量多， 需要旋凍設備凍成殼狀之后，再加上傳熱套，以改進熱量的傳遞，并以臥倒方式放在凍干箱 的板層之上進行凍干。
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