藥用凍干機也稱為制藥凍干機，其特點是制品一般均在同一個干燥箱體內的一組擱板上完成預凍、保溫、升華干燥全部工藝過程。由于同一組擱板既要具備制冷又要實現加溫，所以一般均采用中間媒介進行間接傳導，擱板溫度不均勻和托盤導熱不良好的問題導致能耗大、工藝過程長、沒有達到產品設計殘余含水量標準等問題是長期困繞制藥企業發展的一個關鍵因素。
凍干機一般都將原料裝在托盤內放置在擱板上的托盤內進行凍結、升華干燥、解析干燥的加工，托盤的厚度應要考慮到冷熱變形，因此不能太薄，一般在1.5mm左右，裝有藥品的西林瓶或食品在托盤內盛裝高度約10-15 Mm左右，溫度由擱板的冷熱溫度傳遞到托盤底部開始直到最上端的凍結、升華干燥、解析干燥物品為止。但由于裝有藥品的西林瓶、藥品、生物制品或食品在托盤內盛裝高度約10-15mm左右，溫度的傳遞需要較長時間，再由于擱板溫度不均勻，造成了凍干產品含水率不均勻，產品殘余含水量的合格率受影響。
制造擱板上的托盤是由不銹鋼材料制作的，在凍干時長時間地受熱脹冷縮而會發生變形，于是各廠家都花了大量的人力和財力，如從擱板表面的平整度、表面塞焊點位置、間斷焊所產生的熱脹冷縮及材料等等問題，各種問題都會直接影響擱板至制品與托盤間的熱傳導性能，造成溫度不均勻的原因可能，因此，經常有一些用戶反映的凍干小瓶內殘余含水量不一致，有的相差很大，沒有達到產品設計殘余含水量標準。有的用戶凍干小瓶時用可抽屜式托盤框或散裝小瓶，這樣很浪費裝料和卸料時間，在裝卸料藥瓶時又容易破損，現在國外已開始應用無菌薄膜成形的托盤但價格高、容易損壞、使用時間不長等缺陷。
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