一條合格的食品冷凍干燥機果蔬加工生產線不僅要有質量可靠、自動化程度高、性能優良的設備，而且要求廠房車間面積與設備加工能力相適應，廠房平面布局按工藝流程要求布局合理，這對于合理按排生產，提高生產效率，生產出合格的產品起到非常重要的作用。一般情況下，建一條中等經濟規模的凍干蔬菜生產線其設備的凍干面積應達到800m2，即需要4臺凍干面積為200m2的冷凍干燥機組成。
生產車間按功能分為原料保鮮庫、低溫冷藏庫、粗處理車間、精處理車間、凍干設備間、卸料間、暫存間、挑選間、金探篩選間、包裝間、成品庫等。各車間按功能和工藝流程應合理布局，精處理車間應設消毒洗盤區，裝盤上料區。
冷凍干燥機設備間包括速凍庫和食品冷凍干燥機設備，從速凍庫和干燥的前半部分隔斷分為加工間和機械間，機械間設配電室和監控室。后處理挑選區可分為兩個區域，以便挑選不同產品也可設為一次選別和二次選別。在裝箱間設包裝材料間。
各個車間的人員進出口及物料進出口應合理設置。按衛生要求，精處理車間及挑選區人員進出口處設與車間相連的更衣衛生間，按衛生要求應設進口緩沖區，換鞋間，更衣間，衛生間,淋浴室，洗手消毒間，鳳淋室，精處理車間入口處還應設雨靴消毒池。下料間挑選區，金探篩選間，成品庫，溫度要求小于等于15℃，因此應在合適的位置設置空調機房。按制冷規范要求，冷庫，速凍庫，凍干機的用冷需單獨設制冷站。
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